起初，学校的教学活动在布特林街的一所老房子中开展。1939年9月1日，医学院迎来了首届100名学生，他们在此开始了系统的理论课程学习。1940年，北奥塞梯国立医学院迁至普希金斯卡亚大街40号，新的校址为学院提供了更为优越的物质条件。在此基础上，学院成功组建了医学和生物学系。

卫国战争无疑为学院的建立增加了复杂性。然而，在战争环境下，学院不仅维持了原有教学班的数量，还成功增设了三年级和五年级的系别。1942年，学院因战争需要被疏散至埃里温，并在埃里温医学院的基础上继续开展教育活动。在此期间，北奥塞梯国立医学院首次科学会议在埃里温召开，标志着学院学术研究的新起点。1943年3月，政府鉴于战争形势，决定紧急招收新的一年级学生，以充实医学人才库。同年，北奥塞梯国立医学院重返故土——北奥赛梯-阿兰共和国，并顺利举办了首届医生速成毕业典礼，为战争时期的医疗事业输送了新鲜血液。

1943年，成为医学院专业传记的起点，师生们在抗击敌人的伟大事业中展现了卓越的风采。共有250名教职员工和学生荣获“高加索保卫战”劳动英雄奖章，这是他们辛勤工作和无私奉献的最好证明。在战争期间，北奥赛梯国立医学院的教授和教师们不仅承担着学院的主要工作，还积极参与疏散医院的咨询和治疗工作。他们是专业教研室的创建者，也是众多创新治疗和诊断方法的提出者。这些方法在全国范围内的医院和诊所得到了广泛应用，为战争时期的医疗救治工作做出了重要贡献。

尽管北奥塞梯医学院的成立和发展初期经历了极为艰难的战争和战后时期，但教职员工仍尽最大努力为北奥塞梯医学科学的发展奠定坚实基础。50 年代，学院的高速发展为通过住院医师培训和研究生学习培训青年人才创造了机会。

20世纪60年代，北奥赛梯国立医学院迎来了新一轮发展：许多来自其他城市的科学家的到来使学院的科研和教学人员不断增加。自此，学院的科研和教育工作都得到了显著改善。院的招生人数增加到 400 人，开设了可容纳 50 人的夜校，设立了新的系和课程，与中央大学和科学中心建立了创造性的联系，改善了各系的物质和技术基础。

北奥赛梯国立医科大学自建立之初，就将研究和教学的重心集中在国家最需要的领域：

传染病、寄生虫病和性病的预防、诊断和治疗问题是医学研究所科学研究的重中之重；

内分泌系统的生理学和病理学研究、内分泌疾病的发病机理、治疗和预防是医学院成立以来的首要科研方向之一，得益于这一研究，地方性甲状腺肿的发病率有所下降，并出现了治疗和预防甲状腺毒症和糖尿病的新方法；

北奥塞梯丰富的自然资源和独特且富含矿物质的温泉决定了医学院科学家的另一个重要科学方向--疗养学；

在急诊外科和创伤学科学方面也取得了重大进展。学院引进了使用最新设备的现代诊断和治疗方法，并成立了内窥镜外科中心；

儿科医生的巨大缺口促使北奥赛梯国立医学院于1974年开设了第二个儿科系。儿科系开展的科学、治疗、咨询和预防工作大大降低了共和国的儿童死亡率。

1993年，口腔医学专业首次招生。如今，该学校下设强大的临床基地，即两个多学科口腔综合诊所，配备了现代化的设备和高素质的教学人员。

1995年是医学院工作的新起点。根据俄罗斯联邦高等教育国家委员会1995年2月26日第286号命令，该校被授予“北奥赛梯国立医科大学”这一现用名。这是对大学教学，科研和治疗工作高水平的官方认可。（Северо-осетинская государственная медицинская акаемия）